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福建省排名前十的高校分别是厦门大学、福建师范大学、福州大学、福建农林大学、华侨大学、福建医科大学、福建中医药大学、福建工程学院、集美大学、闽江学院。
1.厦门大学
根据2017年第四轮全国学科评估结果，该校最好的学科是海洋科学，其次是应用经济学、化学、统计学和工商管理。
2.福建师范大学
根据2017年第四轮全国学科评估结果，该校最好的学科是马克思主义理论、体育、音乐、舞蹈，其次是中国语言文学和地理。
3.福州大学
根据2017年第四轮全国学科评估结果，该校最好的学科是化学，其次是管理科学与工程和工商管理。
4.福建农林大学
根据2017年第四轮全国学科评估结果，该校最好的学科是生态学、风景园林、植物保护和林学，其次是生物学、食品科学与工程。
5.华侨大学
学校学科实力稳步提升。国家重点学科、省部级重点学科41个，福建省高峰和高原学科17个，工程、材料科学、化学3个学科进入ESI全球排名前1%。
6.福建医科大学
据国际权威机构统计，临床医学从2009年开始进入ESI前1%。
7.福建中医药大学
根据2017年第四轮全国学科评估结果，该校最好的学科是中西医结合，其次是中医学。
8.福建工程学院
该校的国家特色专业有土木工程、工程造价、电气工程及其自动化。
9.集美大学
根据2017年第四轮全国学科评估结果，该校最好的学科是食品科学与工程、水产，其次是体育和数学。
10.闽江学院
学校在ESI进入了世界前1%，包括普通社会科学和工程科学。
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